Изучено влияние тяжелых случаев течения COVID-19 на иммунные клетки
Новое исследование показывает, как генетические вариации, связанные с тяжелыми случаями COVID-19, влияют на наши иммунные клетки. Среди своих выводов исследователи сообщают, что ген в типе клеток под названием неклассические моноциты, которые являются частью команды врожденных иммунных клеток организма "первого ответа", может быть потенциальной мишенью для терапии COVID-19.
Исследование, проведенное учеными из Института иммунологии Ла Джолла (LJI), является одним из первых глубоких исследований связей между тяжестью COVID-19 и экспрессией генов во многих типах иммунных клеток. Эта работа может помочь в разработке новых методов лечения COVID-19 для усиления функции иммунных клеток.
"Это исследование подчеркивает возможности генетики человека в раскрытии новых путей, связанных с болезнями, - сказал профессор LJI Пандуранган Виджаянанд, доктор медицины, доктор философии, старший автор исследования в Nature Communications.
Научное сообщество выявило множество генетических различий, называемых полиморфизмами, которые они называют "вариантами риска тяжелого COVID-19". Эти генетические варианты связаны с экспрессией генов и, по-видимому, влияют на тяжесть заболевания. Однако ученые не знали, на какие иммунные клетки больше всего влияют эти варианты риска.
В новом исследовании Виджаянанд и его коллеги объединили генетические данные пациентов из Генетической инициативы хозяина COVID-19 и базы данных эпигеномов иммунных клеток LJI (DICE) с открытым доступом, чтобы определить гены и типы восприимчивых клеток, на которые влияют эти варианты риска. Команда исследовала 13 подтипов ключевых защитных и борющихся с вирусами клеток организма: Т-клетки, В-клетки, NK-клетки и моноциты.
"Существует множество различных типов иммунных клеток, и все они вносят небольшой вклад в общую картину", - говорит первый автор исследования Бенджамин Шмидель, доктор философии, преподаватель LJI. "Мы должны рассмотреть каждый тип иммунных клеток в отдельности, чтобы понять, как иммунная система способна реагировать на COVID"
Исследователи выявили несколько важных ассоциаций генетических вариантов с генами. Среди них был вариант риска, который влиял на 12 из 13 изученных типов клеток. Этот тяжелый вариант риска COVID-19 в хромосоме 21 был связан со снижением экспрессии рецептора на клетках под названием IFNAR2. Этот рецептор является частью сигнального пути, который предупреждает иммунную систему об инфекции. Эта новая ассоциация может помочь объяснить, почему некоторые люди не могут дать сильный иммунный ответ на SARS-CoV-2.
Между тем, вариант риска на хромосоме 12 показал самый сильный эффект в неклассических моноцитах - типе клеток врожденного иммунитета, которые патрулируют тело и посылают сигнальные молекулы, чтобы предупредить другие иммунные клетки об угрозе.
Вариант риска привел к тому, что в неклассических моноцитах снизилась экспрессия гена под названием OAS1. Отсутствие экспрессии OAS1 может ослабить защитные силы организма за счет снижения экспрессии семейства белков, которые обычно разрушают вирусную РНК и активируют противовирусные реакции иммунной системы. Шмидель надеется провести дальнейшие доклинические исследования, чтобы определить роль этих генов в патогенезе COVID-19.
